Sesuai dengan visi SMP Negeri 5 Ambarawa yaitu ”membentuk manusia yang beriman, berbudi pekerti luhur, terampil, berprestasi, dan berkarakter mulia” maka sekolah mempunyai program untuk meningkatkan keimanan dan ketaqwaan terhadap Tuhan Yang Maha Esa bagi semua warga sekolah. Setiap hari 15 meit sebelum pelajaran dimulai, bagi yang beragama islam membaca Asmaul Husna bersama, sedangkan yang beragama non muslim melakukan doa pagi sesuai dengan agama dan kepercayaannya masing-masing. Selain itu juga dilakukan sholat dhuhur berjamaah setiap hari Senin – Kamis. Peserta didik juga mulai ditanamkan rasa peduli terhadap teman yang membutuhkan melalui gerakan seribu persiswa serta adanya infaq setiap hari jumat. Sekolah juga melaksanakan peringatan hari besar keagamaan yang dikemas menjadi kegiatan keagamaan.